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antiSMASH 和 2ndfind 可以链接 Blast 进行单基因功能注释吗

时间2023-06-22 14:56:55 提问来自 上海市上海市 的网友 分类创作 浏览509
是的,antiSMASH和2ndfind都可以链接Blast进行单基因功能注释。 在antiSMASH中,可以使用Blast进行基因注释。用户可以选择使用NCBI NR数据库或自己的本地数据库进行Blast。在antiSMASH的结果页面中,用户可以查看每个基因的Blast结果,并根据Blast结果进行基因注释。 2ndfind也可以链接Blast进行单基因功能注释。用户可以使用NCBI NR数据库或自己的本地数据库进行Blast。在2ndfind的结果页面中,用户可以查看每个基因的Blast结果,并根据Blast结果进行基因注释。 需要注意的是,Blast结果仅提供参考,用户需要根据实际情况进行基因注释。

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